Mide, karın boşluğunun sol üst kısmında bulunan kaslı bir kesedir. Mide duvarının iç astarı, mide suyunu salgılayan milyonlarca minik mide bezi içerir ve bu da yiyecekleri eriterek kekik adı verilen kalın bir sıvı oluşturur. Mide suyu, hidroklorik asit, intrinsik faktör (B 12 vitamininin bağırsaktan emilimi için gereklidir ) ve pepsinojen (aktif olmayan bir protein sindirici enzim) gibi çeşitli maddeler içerir . Hidroklorik asit, protein sindirimini başlatmak için sindirilen bakterileri yok etmek ve pepsinojeni aktif formu olan pepsine dönüştürmek gibi çeşitli işlevlere sahiptir.

Midenin alt ucunda, kekiğin ince bağırsağa girmesi için akması gereken pilorik sfinkter bulunur. Çoğu öğün, midenin alt ucuna doğru ilerleyen peristaltik kasılmalar nedeniyle iki ila altı saat sonra yavaş yavaş ince bağırsağa boşaltılır. Çoğu sindirim ve emilim, ince bağırsakta gerçekleşir. İnce bağırsak, duodenum, jejunum ve ileum adlı üç bölümden oluşur. Oniki parmak bağırsağı mideden kekik, pankreastan pankreas suyu ve karaciğerden safra alır (ve safra kesesinde depolanır).

Pankreas suyu, proteinleri, karbonhidratları ve lipitleri sindirebilen sindirim enzimleri içerir . Safra, lipid sindirimi ve emiliminin etkinliğini artırmak için lipitleri emülsifiye eder. Sindirim tamamlandıktan sonra, sindirilen besinler, ince bağırsak duvarındaki kan damarlarına ve lenfatik damarlara emilir.

Peristaltik kasılmalar, kekiği ince bağırsaktan ve kalın bağırsağa taşır. Kalın bağırsak, üç ana bölümden oluşur: çekum (ince bağırsaktan kekik alır), kolon ve rektum. Peristalsis, kekiği kolon boyunca hareket ettirirken, kekik yavaş yavaş dışkı adı verilen yarı katı malzemeye dönüştürmek için su emilir. Dışkı , kolonda yaşayan sindirilemeyen besin molekülleri (birincil selüloz ) ve bağırsak bakterileri (esas olarak Escherichia coli ) içerir. Peristalsis, dışkıyı, dışkılama süreciyle anüs yoluyla atılana kadar depolandıkları rektuma iletir.